1、三類醫(yī)療器械經(jīng)營許可證辦理方式如下：

（1）申請人提交申請資料到相關部門；

（2）相關部門受理申請人的申請；

（3）到實際場地進行勘察以及對產(chǎn)品進行審核；

（4）準予頒發(fā)三類醫(yī)療器械許可證。

2、法律依據(jù)：《醫(yī)療器械監(jiān)督管理條例》第十四條

第一類醫(yī)療器械產(chǎn)品備案和申請第二類、第三類醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊，應當提交下列資料：

（一）產(chǎn)品風險分析資料；

（二）產(chǎn)品技術要求；

（三）產(chǎn)品檢驗報告；

（四）臨床評價資料；

（五）產(chǎn)品說明書以及標簽樣稿；

（六）與產(chǎn)品研制、生產(chǎn)有關的質(zhì)量管理體系文件；

（七）證明產(chǎn)品安全、有效所需的其他資料。

產(chǎn)品檢驗報告應當符合國務院藥品監(jiān)督管理部門的要求，可以是醫(yī)療器械注冊申請人、備案人的自檢報告，也可以是委托有資質(zhì)的醫(yī)療器械檢驗機構(gòu)出具的檢驗報告。

符合本條例第二十四條規(guī)定的免于進行臨床評價情形的，可以免于提交臨床評價資料。

醫(yī)療器械注冊申請人、備案人應當確保提交的資料合法、真實、準確、完整和可追溯。

三類醫(yī)療器械許可證注冊需要材料如下：

1、企業(yè)名稱與經(jīng)營范圍，注冊資本及股東出資比例，股東等身份證明；

2、醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊證書、供應商營業(yè)執(zhí)照、許可證及授權(quán)書；

3、質(zhì)量管理文件等；

4、2個或以上醫(yī)學專業(yè)或相關專業(yè)人員證書、身份證明與簡歷；

5、符合醫(yī)療器械經(jīng)營要求的辦公場地及倉庫證明；

6、公司章程、股東會決議等；

7、財務人員身份證和上崗證；

8、其它相關材料。

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